Qualquer empresa ou sujeito passivo pode emitir facturas electrónicas, se o destinatário da mesma aceitar. Também implica que a empresa emissora da factura electrónica garanta a integridade do seu conteúdo assim como a autenticidade da entidade emissora da factura. Estas garantias são possíveis através da assinatura da factura através de um certificado digital.

Nas prática qualquer empresa poderá aderir ao sistema de facturação electrónica se os seus fornecedores aceitarem. No caso de a empresa possuir apenas alguns parceiros que aceitam e outros não, poderá optar por emitir facturas pelos dois sistemas.